Ja,

sehr wahrscheinlich Getriebe/Schaltmechanik intern;

Nö „ein paar fehlende Zähne im 1. Gang“

Ist eher nicht die naheliegende Erklärung, und wenn sich der Verdacht bestätigt,
geht es an der VNT15A in der Regel nur mit Motorausbau und Gehäuse trennen sauber zu reparieren.

Trost, der Motorblock ist gar nicht so schwer wie er aussieht.

Bei mir; VN15 SE B2, kommt übrigens nur mineralisches SAE 15 W 30(+) rein.

Deine Laufleistung (bestätigt ) ist ja nix!
Was sagt der Ölverbrauch auf 100km?

Mach ma' Öl heiß, ablassen (am besten über die Schraube seitlich) und kontrollieren:
glitzernde Späne, grobe Partikel, Magnet/Ablassschraube prüfen.